Covid-19 : un microbiote intestinal sain peut-il vous protéger ?

Bactérie Prevotella, hôte du coronavirus ?

L’ADN du virus a été retrouvé à l’intérieur même de bactéries de type Prevotella. Cela suggère que le virus serait capable aussi bien d’infecter les cellules humaines que les bactéries. Les infections à Prevotella étant déjà réputées pour provoquer des symptômes respiratoires, une combinaison avec le SARS-CoV-2 pourrait donner lieu à des signes plus sévères.

Pour le Dr Karim OUALI Nutritionniste-Conférencier, “s’il s’avère que le Covid-19 est bien une infection mixte (virale et bactérienne) on comprend l’intérêt d’associer l’hydroxychloroquine et l’antibiothérapie (azithromycine), consacré par le Pr Didier Raoult, et en particulier l’azithromycine qui est active sur Prevotella et sur les microbes intracellulaires”.

Les collectes fécales suspendues par l’ANSM

La confirmation de la présence du coronavirus dans les selles, et sa capacité à se répliquer dans le tube digestif, a conduit l’Agence nationale de sécurité du médicament et des produits de santé (ANSM) à renforcer les mesures de précautions lors des prélèvements et transplantations de matière fécale.

Dans une décision rendue le 16 mars 2020, elle précise que “le caractère infectieux du virus détecté dans les selles et le risque de transmission via une transplantation de microbiote fécal ne peuvent être écartés, ce qui constitue un risque pour la santé de patients présentant par ailleurs d’autres affections”.

C’est pourquoi, en cette période d’épidémie, la transplantation fécale ne pourra plus être exercé que sur des patients dont le pronostic vital est engagé, et pour lesquels il n’existe pas d’alternative thérapeutique. Les médecins doivent utiliser en priorité les stocks préparés avec des dons collectés avant le 30 janvier 2020, date à laquelle le virus a commencé à circuler sur le territoire.

Les dons collectés après cette date ont été placés en quarantaine, et la collecte de selles est pour l’instant suspendue. Après épuisement des stocks “sains”, l’ANSM précise que des prélèvements exceptionnels pourront être réalisés, pour traiter les patients dont le pronostic vital est engagé.

L’administration “pourra être réalisée pour ces patients à partir du don d’un donneur unique, sous réserve de réaliser :

• une sélection clinique complémentaire par rapport à la sélection clinique habituellement prévue, à savoir :
  
  • examen clinique à la recherche d’une infection respiratoire fébrile,
  • questionnaire spécifique permettant de rechercher un séjour dans une zone à risque et/ou un contact avec un patient symptomatique, dans les 28 jours précédant le don ;
• une recherche du génome viral SARS-CoV-2 par amplification génique (RT-PCR) sur un prélèvement naso-pharyngé et sur un échantillon des selles du donneur”.

Des probiotiques contre les symptômes du Covid ?

La prise de probiotiques peut-elle aider les patients qui souffrent de symptômes gastro-intestinaux ? C’est ce que suggère une étude, publiée le 1er février dans le Journal de l’université de Zhejiang. Pour les patients présentant une diminution des Lactobacillus et Bifidobacterium, “un soutien nutritionnel et l'application de prébiotiques ou de probiotiques ont été suggérés pour réguler l'équilibre du microbiote intestinal et réduire le risque d'infection secondaire due à la translocation bactérienne”.

Ces travaux ne précisent pas si ce traitement s’est avéré efficace pour rétablir la flore intestinale et réduire les symptômes gastro-intestinaux liés au Covid-19 chez l’homme. En revanche, une souche de Lactobacillus plantarum, testée sur le cochon, a permis d’empêcher l’infection des cellules épithéliales intestinales par le coronavirus entérique porcin.

Des travaux ont aussi montré que Lactobacillus brevis peut empêcher la bactérie Prevotella de former des biofilms lui permettant de se mettre à l’abri du système immunitaire et des antibiotiques.